১৫২৬ খ্রিস্টাব্দে পানিপথের প্রথম যুদ্ধে মুঘল সম্রাট বাবরের কাছে ইব্রাহিম লোদীর পরাজয়ের মাধ্যমে দিল্লীর সুলতানি শাসনের অবসান হয়।

বাংলাদেশে মুসলিম শাসনের সূত্রপাত করেন ইখতিয়ার উদ্দিন মুহম্মদ বখতিয়ার খলজি। তিনি ১২০৪ সালে সেন বংশের রাজা লক্ষণ সেনকে পরাজিত করে বাংলা দখল করেন। এরপর থেকে বাংলায় মুসলিম শাসনের সূচনা হয়।

বাংলায় 'স্বাধীন সুলতানী' শাসনের প্রতিষ্ঠাতা হিসেবে সাধারণত ফখরুদ্দীন মোবারক শাহ-কে ধরা হয়। তিনি ১৩৩৮ সালে দিল্লীর সুলতানী শাসনের দুর্বলতার সুযোগ নিয়ে সোনারগাঁওয়ে স্বাধীন সুলতানী প্রতিষ্ঠা করেন।